按照全省事业单位改革工作进程的安排，截止到2005年11月15日，省直共有50个部门报送了改革总体方案。这些部门和单位是：
省药监局、省文化厅、省国资委、省环保局、省地税局、省安监局、省经委、省经干院、省知识产权局、省检察院、省旅游局、省测绘局、省粮食局、省人防办、驻深圳办事处、发展研究中心、省审计厅、省民委、省人口计生委、省煤炭局、驻北京办事处、省国土资源厅、省民政厅、省发改委、省残联、省物资集团、省信息产业厅、省林业厅、省委办公厅、省委老干部局、省社科院、省老龄委、省水利厅、省法院、省开发办、省建设厅、省食品办、省档案局、省总工会、省价格监督检查局、省供销社、省财政厅、省政府办公厅、省体育局、省妇联、省司法厅、省科学技术协会、省国防科技工业办、省地质勘查局、省监狱管理局。
其中，省药监局等16个部门的事业单位改革总体方案正式批复。